De Broholmer is voor een groot ras redelijk gezond. Voordat er met een Broholmer kan worden gefokt, moet de hond onderzocht worden op Elleboogdyspalsie (ED) en Heupdysplasie (HD). Deze twee aandoeningen komen eigenlijk weinig voor binnen het ras.
Daarnaast worden de meeste honden voor de fok ook onderzocht op hartafwijkingen zoals aorta-stenose en DCM. Dit komt eveneens af en toe voor, de meeste zijn echter vrij van hartafwijkingen. Vanzelfsprekend wordt er niet gefokt met honden die een afwijking aan het hart hebben.
Ook komt er bij sommige Broholmers voedselallergie of hooikoorts voor, wat zich uit in jeuk en kale plekken. De oudere Broholmers hebben eigenlijk allemaal wel een paar vetbulten. Dit is verder niet gevaarlijk voor hond maar het lijkt niet zo mooi. Als ze te groot worden, kunnen ze weggehaald worden.
Daarnaast geldt er voor de Deense vereniging een gedragstest en een exterieurkeuring of een Zeer Goed of Uitmuntend resultaat op de show. Voor Nederland gelden deze regels niet maar de fokkers in Nederland willen graag meewerken om het ras gezond te houden en doen ook deze testen bij hun honden. Informeer dus bij de fokker welke gezondheidstesten en gedragtest er zijn gedaan bij de ouderdieren.